V návaznosti na stále rostoucí důraz Evropské komise na dosahování a umožňování synergií mezi ESIF a programy přímo řízenými Evropskou komisí byla zpracována Analýza programů EU. Cílem Analýzy bylo získat informace o fungování komunitárních programů, které svou doplňkovostí vstupují do Dohody o partnerství a operačních programů v období 2014–2020, zapojení českých žadatelů do těchto programů, to vše vč. stanovení silných a slabých stránek a návrhů doporučení. Analýza byla zpracována na podzim 2016, její výsledky vč. prezentace ze semináře konaného na Ministerstvu pro místní rozvoj dne 5. prosince 2016 jsou ke stažení níže.